Deuxième doyen de la Faculté de chirurgie dentaire de l’Université de Montréal en poste de 1943 à 1957, Ernest Charron a poursuivi l’œuvre de son prédécesseur Eudore Dubeau et a consolidé la renommée de la Faculté en France comme en Amérique. Alors que les spécialités n’existaient pas encore au sein de la profession dentaire, il s’était déjà, par des visites et des stages aux États-Unis et en France, s’était qualifié plus avant dans les champs de l’anesthésie et la chirurgie, ce qui lui permit de se faire admettre dans le personnel de l’hôpital Notre-Dame et de prendre charge du Service de stomatologie. Ses relations avec le monde de la politique provinciale lui ont valu d’être parmi les candidats à la succession d’Alexandre Taschereau à la tête du parti libéral provincial. Son attachement à la Faculté, parmi aussi d’autres considérations, a prévalu sur l’attrait du pouvoir et a joué en faveur d’une carrière académique déjà bien engagée.

Choisi unanimement par la profession et par ses collègues de la Faculté pour diriger cette institution, il réussit en dépit de conditions défavorables pendant les années de la Guerre ‘39-45 à rehausser le moral de son équipe, à consolider le prestige de la Faculté et à moderniser les installations pour les besoins de l’enseignement. Il a su profiter des quelques avantages de la souscription de 1948 et de la mise en place de la nouvelle charte de 1950. Sa participation aux organismes dentaires canadiens et américains aura été largement remarquée en ce que les effets de cette collaboration mèneront au projet d’agrément dont la réciprocité s’appliquera à l’ensemble des écoles dentaires d’Amérique du Nord. Il innova en créant le premier programme d’orthodontie et en popularisant la formation continue par des programmes bien adaptés aux moyens et aux besoins des dentistes en pratique grâce à l’aide reçue de la fondation Kellogg. A la fin de sa carrière, il fut nommé doyen émérite, un titre qu’il est le seul à porter à l’Université de Montréal. Son nom est attaché à la salle du conseil de la Faculté.