Premier doyen de la Faculté des études supérieures, Henri Favre a été le principal artisan de l’intégration des études de 2e et 3e cycle à la structure facultaire de l’Université de Montréal.

C’est en 1952 que Henri Favre entre à l’Université de Montréal. Il y enseigne la chimie et dirige le Département de chimie avant d’être nommé, en 1963, adjoint au recteur et de travailler à la rédaction d’un des premiers rapports de planification et d’analyse prévisionnelle de l’Université, Les bases académiques d' un plan quinquennal pour les années 1964-1969. Doyen de la Faculté des sciences de 1964 à 1968, il fait preuve de qualités d’organisateur qui sont mises à profit lors de la création, en 1972, de la Faculté des études supérieures. Sous son mandat, la FES, qui diplôme aussi les maîtres et les docteurs de l’École Polytechnique et de l’École des Hautes Études Commerciales, définit sa mission et restructure les programmes des cycles supérieurs : établissement de standards d’excellence, harmonisation de l’enseignement, création de programmes multidisciplinaires, encadrement de la formation des chercheurs. Henri Favre assumera par la suite la charge de doyen de la Faculté de musique et terminera sa carrière comme professeur honoraire au Département de chimie.

Personnage de l’ombre, Henri Favre est, avec le recteur Roger Gaudry, celui qui a le mieux incarné les aspirations du milieu universitaire à une époque où l’Université de Montréal se modernisait et accédait au rang de grande université de recherche.