La crise économique de 1929 et ses conséquences ont un effet désastreux sur le développement de l’Université de Montréal. Le 23 septembre 1931, les travaux du chantier Cormier sont interrompus. Ils ne reprendront que dix ans plus tard. Pendant les années trente, faute de liquidités, l’Université se voit dans l’incapacité, à quelques reprises, de payer son personnel.
Pour répondre à ces problèmes le gouvernement du Québec crée en 1939 une Société d’administration qui gère les activités de l’Université de Montréal pendant onze ans, soit jusqu’à la promulgation de la charte de 1950. Cette société est présidée de 1940 à 1950 par Monseigneur Joseph Charbonneau, archevêque de Montréal et chancelier de l’Université de Montréal. La Société d’administration, favorisée par l’amélioration du contexte économique, par la demande accrue de personnels spécialisés causée par la guerre et par le soutien du gouvernement, arrive à stabiliser la situation.